| 序号 | 课程名称 | 总学时 | 授课对象 | 备注 | 
| 1 | 高等有机化学 | 54 | 硕士、博士 | 专业必修 | 
| 2 | 高等有机化学实验 | 144 | 硕士、博士 | 专业必修 | 
| 3 | 高等有机合成 | 54 | 硕士、博士 | 专业必修 | 
| 4 | 高等有机合成试验 | 144 | 硕士、博士 | 专业必修 | 
| 5 | 高等有机化学与合成 | 72 | 硕士 | 专业选修 | 
| 6 | 糖化学与化学糖生物学 | 36 | 硕士 | 专业选修 | 
| 7 | 杂环化合物合成方法及进展 | 18 | 硕士 | 专业选修 | 
| 8 | 生物有机化学 | 36 | 硕士 | 专业选修 | 
| 9 | 有机化学研究进展 | 36 | 硕士 | 专业选修 | 
| 10 | 化学生物学I-概论 | 72 | 硕士、博士 | 专业必修 | 
| 11 | 化学生物学高级实验 | 144 | 硕士、博士 | 专业必修 | 
| 12 | 生物无机和无机药物化学 | 57 | 硕士 | 专业必修 | 
| 13 | 酶化学 | 18 | 硕士 | 专业选修 | 
| 14 | ADME-Tox方法 | 18 | 硕士 | 专业选修 | 
| 15 | 细胞无机化学 | 36 | 博士 | 专业必修 | 
| 16 | 固态生物无机化学 | 36 | 博士 | 专业必修 | 
| 17 | 数理统计在药学中的应用 | 20 | 硕士 | 专业必修 | 
| 18 | 生化分析 | 36 | 硕士 | 专业必修 | 
| 21 | 高等仪器分析 | 36 | 硕士 | 专业必修 | 
| 22 | 高等仪器分析实验 | 72 | 硕士 | 专业必修 | 
| 23 | 高等药物分析 | 36 | 硕士 | 专业必修 | 
| 24 | 高等药物分析实验 | 72 | 硕士 | 专业必修 | 
| 25 | 生物药物分析 | 36 | 硕士 | 专业必修 | 
| 26 | 高效毛细管电泳 | 36 | 硕士 | 专业选修 |